Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Shank3Q4ACU6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shank3Q4ACU6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms