Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Brinp3Q499E0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Brinp3Q499E0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Brinp3Q499E0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms