Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ckap2Q3V1H1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ckap2Q3V1H1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ckap2Q3V1H1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms