Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hipk4Q3V016 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hipk4Q3V016 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms