Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed1Q3V009 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed1Q3V009 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms