Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZY0

Sfi1, Protein SFI1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfi1Q3UZY0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfi1Q3UZY0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfi1Q3UZY0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfi1Q3UZY0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfi1Q3UZY0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfi1Q3UZY0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfi1Q3UZY0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfi1Q3UZY0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfi1Q3UZY0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfi1Q3UZY0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfi1Q3UZY0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfi1Q3UZY0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfi1Q3UZY0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfi1Q3UZY0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfi1Q3UZY0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfi1Q3UZY0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfi1Q3UZY0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfi1Q3UZY0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfi1Q3UZY0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfi1Q3UZY0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfi1Q3UZY0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfi1Q3UZY0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfi1Q3UZY0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sfi1Q3UZY0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sfi1Q3UZY0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sfi1Q3UZY0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sfi1Q3UZY0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sfi1Q3UZY0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sfi1Q3UZY0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Sfi1Q3UZY0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms