Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rnpc3Q3UZ01 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Rnpc3Q3UZ01 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rnpc3Q3UZ01 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rnpc3Q3UZ01 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnpc3Q3UZ01 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnpc3Q3UZ01 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnpc3Q3UZ01 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rnpc3Q3UZ01 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnpc3Q3UZ01 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnpc3Q3UZ01 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnpc3Q3UZ01 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnpc3Q3UZ01 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnpc3Q3UZ01 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnpc3Q3UZ01 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnpc3Q3UZ01 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnpc3Q3UZ01 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnpc3Q3UZ01 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnpc3Q3UZ01 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rnpc3Q3UZ01 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rnpc3Q3UZ01 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rnpc3Q3UZ01 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms