Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV9

Ncbp1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp1Q3UYV9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncbp1Q3UYV9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncbp1Q3UYV9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncbp1Q3UYV9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncbp1Q3UYV9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncbp1Q3UYV9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncbp1Q3UYV9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncbp1Q3UYV9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncbp1Q3UYV9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncbp1Q3UYV9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncbp1Q3UYV9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncbp1Q3UYV9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncbp1Q3UYV9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncbp1Q3UYV9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncbp1Q3UYV9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncbp1Q3UYV9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncbp1Q3UYV9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncbp1Q3UYV9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms