Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prom2Q3UUY6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prom2Q3UUY6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms