Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Klhdc9Q3USL1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhdc9Q3USL1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms