Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm28047Q3US59 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm28047Q3US59 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms