Protein–RNA interactions for Protein: Q3URS3

Lrcol1, Leucine-rich colipase-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrcol1Q3URS3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrcol1Q3URS3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrcol1Q3URS3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms