Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQH6

Gm5127, Predicted gene 5127, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5127Q3UQH6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gm5127Q3UQH6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm5127Q3UQH6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm5127Q3UQH6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5127Q3UQH6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms