Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp30Q3UN04 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp30Q3UN04 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp30Q3UN04 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp30Q3UN04 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp30Q3UN04 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp30Q3UN04 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp30Q3UN04 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp30Q3UN04 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp30Q3UN04 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp30Q3UN04 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp30Q3UN04 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp30Q3UN04 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp30Q3UN04 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp30Q3UN04 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp30Q3UN04 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp30Q3UN04 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp30Q3UN04 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp30Q3UN04 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp30Q3UN04 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp30Q3UN04 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Usp30Q3UN04 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp30Q3UN04 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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