Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ankrd27Q3UMR0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd27Q3UMR0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd27Q3UMR0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd27Q3UMR0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ankrd27Q3UMR0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms