Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cog7Q3UM29 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms