Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lsg1Q3UM18 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lsg1Q3UM18 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lsg1Q3UM18 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsg1Q3UM18 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsg1Q3UM18 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsg1Q3UM18 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsg1Q3UM18 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsg1Q3UM18 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lsg1Q3UM18 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms