Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ell2Q3UKU1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ell2Q3UKU1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms