Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcgf5Q3UK78 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcgf5Q3UK78 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcgf5Q3UK78 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcgf5Q3UK78 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcgf5Q3UK78 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcgf5Q3UK78 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcgf5Q3UK78 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcgf5Q3UK78 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcgf5Q3UK78 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcgf5Q3UK78 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcgf5Q3UK78 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcgf5Q3UK78 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcgf5Q3UK78 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcgf5Q3UK78 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pcgf5Q3UK78 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcgf5Q3UK78 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcgf5Q3UK78 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcgf5Q3UK78 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcgf5Q3UK78 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcgf5Q3UK78 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcgf5Q3UK78 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcgf5Q3UK78 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcgf5Q3UK78 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcgf5Q3UK78 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcgf5Q3UK78 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pcgf5Q3UK78 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms