Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp19Q3UJD6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp19Q3UJD6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms