Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Edc4Q3UJB9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Edc4Q3UJB9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Edc4Q3UJB9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms