Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf3b2Q3UJB0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sf3b2Q3UJB0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sf3b2Q3UJB0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms