Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snx27Q3UHD6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx27Q3UHD6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms