Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Garem1Q3UFT3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Garem1Q3UFT3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Garem1Q3UFT3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Garem1Q3UFT3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Garem1Q3UFT3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Garem1Q3UFT3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Garem1Q3UFT3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Garem1Q3UFT3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Garem1Q3UFT3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Garem1Q3UFT3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Garem1Q3UFT3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Garem1Q3UFT3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Garem1Q3UFT3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Garem1Q3UFT3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Garem1Q3UFT3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Garem1Q3UFT3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Garem1Q3UFT3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Garem1Q3UFT3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Garem1Q3UFT3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Garem1Q3UFT3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Garem1Q3UFT3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Garem1Q3UFT3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Garem1Q3UFT3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Garem1Q3UFT3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Garem1Q3UFT3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms