Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms