Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Puf60Q3UEB3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Puf60Q3UEB3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms