Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf180Q3U827 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf180Q3U827 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
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