Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5F4

Yrdc, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YrdcQ3U5F4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YrdcQ3U5F4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
YrdcQ3U5F4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms