Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kdm4dQ3U2K5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kdm4dQ3U2K5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134 ms