Protein–RNA interactions for Protein: Q3TY92

Mbd6, Methyl-CpG-binding domain protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd6Q3TY92 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd6Q3TY92 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mbd6Q3TY92 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mbd6Q3TY92 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mbd6Q3TY92 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mbd6Q3TY92 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mbd6Q3TY92 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd6Q3TY92 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd6Q3TY92 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd6Q3TY92 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd6Q3TY92 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd6Q3TY92 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd6Q3TY92 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd6Q3TY92 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd6Q3TY92 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd6Q3TY92 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd6Q3TY92 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd6Q3TY92 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd6Q3TY92 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd6Q3TY92 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd6Q3TY92 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd6Q3TY92 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd6Q3TY92 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd6Q3TY92 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd6Q3TY92 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd6Q3TY92 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd6Q3TY92 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd6Q3TY92 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd6Q3TY92 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd6Q3TY92 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd6Q3TY92 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms