Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trmt1Q3TX08 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms