Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT38

D17Wsu92e, Uncharacterized protein C6orf106 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17Wsu92eQ3TT38 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
D17Wsu92eQ3TT38 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
D17Wsu92eQ3TT38 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms