Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRR0

Map9, Microtubule-associated protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map9Q3TRR0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Map9Q3TRR0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Map9Q3TRR0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Map9Q3TRR0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Map9Q3TRR0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Map9Q3TRR0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Map9Q3TRR0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Map9Q3TRR0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Map9Q3TRR0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Map9Q3TRR0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Map9Q3TRR0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Map9Q3TRR0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Map9Q3TRR0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Map9Q3TRR0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Map9Q3TRR0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Map9Q3TRR0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Map9Q3TRR0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Map9Q3TRR0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Map9Q3TRR0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Map9Q3TRR0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Map9Q3TRR0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Map9Q3TRR0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Map9Q3TRR0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Map9Q3TRR0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Map9Q3TRR0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Map9Q3TRR0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Map9Q3TRR0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Map9Q3TRR0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Map9Q3TRR0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Map9Q3TRR0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Map9Q3TRR0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Map9Q3TRR0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Map9Q3TRR0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms