Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calr4Q3TQS0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms