Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc13Q3TIR1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc13Q3TIR1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111 ms