Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf2f1Q3THK3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms