Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
V1rd19Q3KNP5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
V1rd19Q3KNP5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
V1rd19Q3KNP5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
V1rd19Q3KNP5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
V1rd19Q3KNP5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
V1rd19Q3KNP5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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V1rd19Q3KNP5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
V1rd19Q3KNP5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
V1rd19Q3KNP5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
V1rd19Q3KNP5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
V1rd19Q3KNP5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
V1rd19Q3KNP5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
V1rd19Q3KNP5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
V1rd19Q3KNP5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
V1rd19Q3KNP5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
V1rd19Q3KNP5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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V1rd19Q3KNP5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
V1rd19Q3KNP5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
V1rd19Q3KNP5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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V1rd19Q3KNP5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
V1rd19Q3KNP5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
V1rd19Q3KNP5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
V1rd19Q3KNP5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
V1rd19Q3KNP5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
V1rd19Q3KNP5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
V1rd19Q3KNP5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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V1rd19Q3KNP5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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V1rd19Q3KNP5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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V1rd19Q3KNP5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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V1rd19Q3KNP5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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V1rd19Q3KNP5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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V1rd19Q3KNP5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
V1rd19Q3KNP5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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