Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
H2-M3Q31093 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M3Q31093 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms