Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hdgfl1Q2VPR5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms