Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vax1Q2NKI2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms