Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Shroom4Q1W617 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Shroom4Q1W617 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms