Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2b3Q0VF55 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp2b3Q0VF55 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2b3Q0VF55 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms