Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rundc1Q0VDN7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms