Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb8Q0VBD0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb8Q0VBD0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms