Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Vps8Q0P5W1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Vps8Q0P5W1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Vps8Q0P5W1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms