Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Neurl1bQ0MW30 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Neurl1bQ0MW30 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms