Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ttc21bQ0HA38 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ttc21bQ0HA38 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms