Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnnm1Q0GA42 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnnm1Q0GA42 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms