Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnn1Q08091 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms