Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AmbpQ07456 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AmbpQ07456 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms